Professeure

Souhir Marsit

Départements
Département de biologie, chimie et géographie
Campus
Campus de Rimouski
Téléphone sans frais
Bureau
B-020

  • Biologie
  • Évolution moléculaire
  • Génomique
  • Biologie moléculaire
  • Microbiologie
  • Instabilité génomique
  • Adaptation
  • Champignons unicellulaires (Levures)
  • Évolution expérimentale

  • Post-doctorat à l’Université Laval, Québec, Canada (2016 – 2020)
  • Post-doctorat à l’INRAE de Montpellier et à l’Institut Curie, Paris, France (2015 – 2016)
  • Doctorat en Microbiologie et biotechnologie à l’UMR Sciences Pour L’Œnologie à l’INRAE, SupAgro, Montpellier, France (2011 – 2014). 
  • Master en Biologie des Génomes à l’Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines, Paris, France (2010 – 2011).
  • Diplôme d’Ingénieur en Biologie Industrielle et Biotechnologie à l’Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie, Tunis, Tunisie (2005 – 2010).

Mon programme de recherche a pour objectif d’utiliser des approches multidisciplinaires et des technologies à haut débit afin de mieux comprendre les processus moléculaires sous-jacents à l’instabilité génomique (ING), les facteurs influençant son émergence, son impact sur l’évolution du génome et l’adaptation à l’environnement. L’ING est un phénomène cellulaire complexe dont l’effet principal est une augmentation de la variation génétique et phénotypique, ce qui pourrait avoir un impact majeur sur l’adaptation à des environnements extrêmes et fluctuants. L’étude de l’ING constitue ainsi un enjeu majeur en biologie évolutive par rapport aux changements climatiques actuels et futurs. En utilisant différentes espèces de levures naturelles comme modèle, ce projet vise à assouvir le besoin critique de faire le lien entre les processus cellulaires impliqués dans l’ING étudiés dans les domaines allant de la biodiversité et l’écologie à la médecine.

À venir

À venir

À venir

À venir

  • Marsit S, Hénault H, Charron G, Fijarczyk A, and Landry CR. (2021). The neutral rate of whole-genome duplication varies among yeast species and their hybrids. Nature Communications 12 (1): 3126.
  • Mozzachiodi S, Tattini L, Llored A, Irizar A, Škofljanc A, D’Angiolo M, De Chiara M P, Barré B, Yue JX, Lutazi A, Loeillet S, Laureau R, Marsit S, Stenberg S, Albaud B, Persson K, Legras JL, Dequin S, Warringer J, Nicolas A, Liti, G. (2021). Aborting meiosis overcomes hybrid sterility. BioRxive: https://doi.org/10.1.
  • Bautista C, Marsit S and Landry CR. (2020). Interspecific hybrids show a reduced adaptive potential under DNA damaging conditions. Evolutionary Applications./li>
  • Hénault M, Marsit S, Charron G, Fijarczyk A and Landry CR. (2020). Transposable elements dynamics in the face of hybridization: insights from the wild yeast Saccharomyces paradoxus. eLife, 9, e60474.
  • Fijarczyk A, Hénault M, Marsit S and Landry CR. (2020). Genome sequence of an archeological yeast strain from 18th century vaults in Quebec City. G3, 10(9):3087-3097.
  • Becerra-Rodriguez C, Marsit S and Galeote V. (2020). Diversity of oligopeptide transport in yeast and its impact on adaptation to winemaking conditions. Frontiers in Genetics, 11 (June): 602.
  • Charron G*, Marsit S*, Hénault M, Martin H and Landry CR. (2019). Spontaneous whole-genome duplication restores fertility in interspecific hybrids. Nature Communications, 10(1):4126. (* contribution égale).
  • Legras JL, Galeote V, Bigey F, Camarasa C, Marsit S, Thibault N, Sanchez I, Couloux A, Franco-Duarte R, Schuler D, Sampaio JP and Dequin S. (2018). Adaptation of S. cerevisiae to fermented food environments reveals remarkable genome plasticity and the footprints of domestication. Molecular Biology and Evolution, 35(7):1712–1727.
  • Marsit S, Dion-côte AM, Barbash DA. (2018). Did mitochondria kill the frog? Developmental Cell, 44(5):539-541.
  • Marsit S, Leducq JB, Durant E, Machand A, Filteau M and Landry CR. (2017). Evolutionary biology through the lens of budding yeast comparative genomics. Nature Reviews Genetics, 18(10): 581-598. (A fait la couverture du journal)
  • Coi AL, Bigey F, Mallet S, Marsit S, Zara G, Gladieux P, Galeote V, Budroni M, Dequin S, Legras JL. (2017). Genomic signatures of adaptation to wine biological ageing conditions in biofilm-forming flor yeasts. Molecular Ecology, 26(7): 2150-2166. 
  • Dupont J, Dequin S, Giraud T, Le Tacon F, Marsit S, Ropars J, Richard F, Selosse MA. (2017). Fungi as a source of food. The fungal kingdom. Microbiology Spectrum, 3(5): FUNK-0030-2016. 
  • Marsit S, Galeote V, Sanchez I, Dequin S. (2016). Horizontally acquired oligopeptide transporters favor adaptation of Saccharomyces cerevisiae wine yeast to enological environment. Environmental Microbiology, 18(4): 1148–1161.
  • Marsit S, Dequin S. (2015). Diversity and adaptive evolution of Saccharomyces wine yeast: a review. FEMS Yeast Research, 15(7): fov067.
  • Marsit S, Mena A, Bigey F, Sauvage FX, Couloux A, Guy J, Legras JL, Barrio E, Dequin S, Galeote V. (2015). Evolutionary Advantage Conferred by an Eukaryote-to-Eukaryote Gene Transfer Event in Wine Yeasts. Molecular Biology and Evolution, 32(7):1695-707.
  •  Despalins A, Marsit S, Oberto J. (2011). Absynte: a web tool to analyze the evolution of orthologous archaeal and bacterial gene clusters. Bioinformatics, 27(20): 2905-2906.
  • Marsit S, Hénault M, Charron G and Landry CR.: The rate of whole-genome duplication can be accelerated by hybridization. Polyploidy webinar. 14 Septembre 2020. (https://www.youtube.com/watch?v=nXQz7aYj5eI&ab_channel=MikeBarker)
  • Marsit S, Hénault M, Charron G and Landry CR.: The rate of Whole genome duplication over different levels of parental divergence in hybrids. International SMBE 2020, Québec, Canada. 28 juin- 2 juillet 2020. (Sélectionnée pour un oral mais le congrès a été annulé à cause de la pandémie de COVID-19).
  • Marsit S, Charron G, Hénault M, Martin H and Landry CR.: Intrinsic ploidy instability drives fertility recovery in experimental hybrid populations. International EMBO workshop on Comparative genomics of eukaryotic microbes, Sant Feliu de Guixols, Espagne. 14-19 Octobre 2019.
  • Marsit S, Charron G, Hénault M, Martin H and Landry CR.: Ploidy changes and genome instability within intra and interspecific yeast hybrids. International congress RECOMB Comparative Genomics 2018, Magog-Orford (Sherbrooke), Québec, Canada, 9-12 Octobre 2018.
  • Marsit S, Mena A, Bigey F, Sauvage FX, Couloux A, Legras JL, Barrio E, Dequin S, Galeote V.: Adaptive advantage conferred by an Eukaryote-to-Eukaryote gene transfer event in wine yeasts, EMBO Exploring the genomic complexity and diversity of eukaryotes, Sant Feliu de Guixols, Espagne. 17-22 Octobre 2015. (Prix de la meilleure présentation orale)
  • Marsit S, Mena A, Bigey F, Legras JL, Barrio E, Dequin S and Galeote V: Adaptive advantage of oligopetide transporters acquired by horizontal transfer during wine fermentation, Oeno 2015 10ème symposium international d’oenologie de Bordeaux, Bordeaux, France. 29 juin-01 juillet 2015.
  • Marsit S, Galeote V, Bigey F, Legras JL, Dequin S.: Adaptive role of horizontally transferred oligopeptide transporters in wine yeasts, ISSY31 31st international specialised symposium on yeast. Nova Gorica, Slovénie. 09-12 Octobre 2014.
  • Marsit S, Galeote V, Bigey F, Legras JL, Dequin S.: Les transporteurs d’oligopeptides fot1/2 acquis par transfert horizontal de gènes ont un rôle adaptatif durant la fermentation oenologique, LMO11 Colloque francophone «Levures, Modèles et Outils», Bordeaux, France. 07-09 Avril 2014.

Premier cycle :

Deuxième cycle :