• DESS en administration des affaires, Université Laval
• Doctorat en chimie, Université de Sherbrooke
• Maîtrise en chimie, Université de Sherbrooke
• Baccalauréat en chimie avec spécialisation en matériaux industriels, Université de Sherbrooke

Il s’intéresse à la recherche fondamentale et appliquée portant sur la chimie des polysaccharides, tout en y incorporant plusieurs principes de la chimie verte. Il a développé une expertise sur l’utilisation du chitosane, un aminopolysaccharide qui provient des résidus de la pêche aux crustacés. Il s’intéresse tout particulièrement à la transformation chimique, la caractérisation et la quantification des polysaccharides pour des applications variées (antibactérien, agent de séquestration, catalyseurs, fertilisants, etc.). Auteur d’articles scientifiques et de brevets, il collabore régulièrement avec des entreprises pour le développement de nouveaux produits d’origine naturelle et la mise à l’échelle des technologies. Il a également travaillé à la solubilisation et à la saccharification d’algues pour leur valorisation.

• Jean-Philippe Denis, maîtrise sur mesure en chimie, 2022, Développement d’une méthode de détermination du degré de quaternisation par RMN ¹³C à l’état solide pour un adsorbant de TMC et l’étude de ses propriétés de séquestration pour l’arsenic
• Maxime Lévesque-Riopel, maîtrise sur mesure en chimie, 2022, Valorisation de l’acide D-glucarique par une synthèse rapide, simple, verte et sans solvant de polyamides linéaires et non protégés à partir d’un dérivé estérifié
• Véronique Langlois, maîtrise sur mesure en chimie, 2021, Identification et quantification de phytohormones dans les macroalgues de l’est du Canada
• Roxanne Brion-Roby, maîtrise en ingénierie, 2017, Traitement d’eaux contaminées par l’arsenic et par le molybdène à partir d’un nouvel adsorbant de chitosane
• Marie-Laine Roy, maîtrise en océanographie, 2015, Nouvelle méthode de séquestration des NP Ag dans les eaux usées et interactions dans différentes conditions
• Alaeddine Kibeche, maîtrise en océanographie, 2015, Nouvelle méthode de séquestration des nanoparticules d’argent dans l’eau et l’eau de mer synthétique
• Mathieu Babin, maîtrise en chimie (Université Laval), 2011, Synthèse, caractérisation et activité de complexes asymétriques polysaccharidiques
• Alain Binette, maîtrise en océanographie, 2008, Transformations chimiques et développement de polyligands chiraux à partir du chitosane, un polysaccharide d’origine marine

• 2020-2022 Doyen aux affaires départementales à l’Université du Québec à Rimouski
• 2019-2020 Doyen des études par intérim à l’Université du Québec à Rimouski

• Chercheur régulier du Centre québécois sur les matériaux fonctionnels (CQMF)
• Chercheur régulier de l’Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels (INAF)

• J.-P. Denis, J. Gagnon, Determination of the degree of quaternization of N,N,N-trimethylchitosan by CP-MAS ¹³C NMR, Carbohydrate Research, 2023, 523, 108736. https://doi.org/10.1016/j.carres.2022.108736
• Y. D. Soubaneh, S. Ouellet, C. Dion, J. Gagnon, Formation of highly quaternized N,N,N‑trimethylchitosan: A chemoselective methodology in aqueous media, Pure and Applied Chemistry, 2019, 91, 489‑496. https://doi.org/10.1515/pac-2018-0924
• P.-O. Morisset, J. Gagnon, R. Tremblay, J.-S. Deschênes, Development and validation of an in situ and real-time quantification method for bicarbonate, carbonate and orthophosphate ions by ATR FT-IR spectroscopy in aqueous solutions. Analyst, 2018, 143: 4387–4393. https://doi.org/10.1039/C8AN00687C
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes, B. Chabot, Adsorption and desorption of molybdenum(VI) in contaminated water using a chitosan sorbent, Journal of Water Process Engineering, 2018, 23, 13-19. https://doi.org/10.1016/j.jwpe.2018.02.016
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes, B. Chabot, Investigation of fixed bed adsorption column operation parameters using a chitosan material for treatment of arsenate contaminated water, Journal of Environmental Chemical Engineering, 2018, 6, 505-511. https://doi.org/10.1016/j.jece.2017.12.032
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes, B. Chabot, Development and treatment procedure of arsenic-contaminated water using a new and green chitosan sorbent: Kinetic, isotherm, thermodynamic and dynamic studies, Pure and Applied Chemistry, 2018, 90, 63-77. https://doi.org/10.1515/pac-2017-0305
• J. Gagnon, N,N,N-Trialkylaminopolymers, methods of their preparation and uses thereof, brevet japonais 6346561, 2018.
• M. Ben Hafsa, M. Benismail, M. Ghrab, A. Raies, J. Gagnon, K. Naghmouchi, Antimicrobial, antioxidant and cytotoxic properties of water-soluble polysaccharides extracted from microalgae Isochrysis galbana and Nannochloropsis oculata, Journal of the Serbian Chemical Society, 2017, 82, 509‑522.
• M.-L. Roy, C. Gagnon, J. Gagnon, New method for sequestration of silver nanoparticles in aqueous media: In route toward municipal wastewater, Chemistry Central Journal, 2016, 10:54. doi: 10.1186/s13065-016-0198-4
• J. Gagnon, N,N,N-trialkylaminopolymers, methods of their preparation and uses thereof, US 9,505,852 B2, brevet américain, 2016.
• A. Kibeche, A. Dionne, R. Brion-Roby, C. Gagnon, J. Gagnon, Simple and green technique for sequestration and concentration of silver nanoparticles by polysaccharides immobilized on glass beads in aqueous media, Chemistry Central Journal, 2015, 9:34. https://doi.org/10.1186/s13065-015-0110-7
• J.-M. Girard, M.-L. Roy, M. Ben Hafsa, J. Gagnon, N. Faucheux, M. Heitz, R. Tremblay, J.-S. Deschênes, Mixotrophic Cultivation of Green Microalgae Scenedesmus obliquus on Cheese Whey Permeate for Biodiesel Production, Algal Research, 2014, 5, 241-248. https://doi.org/10.1016/j.algal.2014.03.002
• J. Gagnon, N,N,N-Trialkylaminopolymers, methods of their preparation and uses thereof, European Patent 12800482.7, 2014.
• J.-M. Girard, J.-S. Deschênes, R. Tremblay, J. Gagnon, FT-IR/ATR Univariate and Multivariate Calibration Models for in situ Monitoring of Sugars in Complex Microalgal Culture Media, Bioresource Technology, 2013, 144, 664-668. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2013.06.094
• M. Babin, R. Clément, J. Gagnon, F.-G. Fontaine, Homogeneous Asymmetric Transfer Hydrogenation of Ketones using a Ruthenium Catalyst Anchored on Chitosan: Natural Chirality at Work, New Journal of Chemistry, 2012, 36 (8), 1548-1551. https://doi.org/10.1002/chin.201302038
• M. Babin, A. Ruest, G. Drouin, K. Sirois, S. Ouellet, J. Gagnon, Regioselective Pivaloylation of N‑Phthaloylchitosan: A Promising Soluble Intermediate for Chitosan Chemistry, Carbohydrate Research, 2012, 351, 87-92. https://doi.org/10.1016/j.carres.2012.01.016
• J. Gagnon et A. Binette, Chitosan Salts, Methods of Manufacture and Uses Thereof, brevet WO/2008/141452.
• A. Binette, J. Gagnon, Regioselective Silylation of N-Phthaloylchitosan with TBDMS and TBDPS Groups, Biomacromolecules, 2007, 8, 1812-1815. doi: 10.1021/bm0610976
• P. Mongrain, J. Douville, J. Gagnon, M. Drouin, A. Decken, D. Fortin, P. D. Harvey, New insights about the host-guest chemistry of the tungsten oxo complex of calix[4]arene, and novel « one pot » difunctionalizations of calix[4]arene using tetrachlorometal(VI) oxide (M = Mo, W), Canadian Journal of Chemistry, 2004, 82, 1452-1461. https://doi.org/10.1139/v04-097
• F. Plourde, K. Gilbert, J. Gagnon, P. D. Harvey, Syntheses and characterization of upper rim 1,2- and 1,3-diphosphinated calix[4]arenes and their corresponding 1,5-cyclooctadienylrhodium(I) complexes: Comparison of the catalytic hydroformylation properties of terminal alkenes, Organometallics, 2003, 22, 2862-2875. https://doi.org/10.1021/om030095o
• J. Gagnon, M. Drouin et P. D. Harvey, Upper-rim Functionalization of Calix[4]arene by Chloro(isocyanide)gold(I) Groups: An Entry to Polymetallic Architecture, Inorganic Chemistry, 2001, 40, 6052-6056. https://doi.org/10.1021/ic010640i
• J. Gagnon, M. Vézina, M. Drouin, P. D. Harvey, Regioselective Upper-Rim Functionalizations of Calix[4]arene by Diphenylphosphine Groups, Canadian Journal of Chemistry, 2001, 79, 1439-1446. https://doi.org/10.1139/v01-161
• M. Vézina, J. Gagnon, K. Villeneuve, M. Drouin, P. D. Harvey, (h⁵‑Pentamethylcyclopentadienyl)rhodium Complexes of Upper-Rim Monophosphinated Calix[4]arene, Organometallics, 2001, 20, 273-281. Doi :
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• M. Vézina, J. Gagnon, K. Villeneuve, M. Drouin, P. D. Harvey, Upper-rim Monofunctionnalization of Calix[4]arene by Organometallic Diphenylphosphinorhodium Complexes, Chemical Communications, 2000, 1073‑1074. https://doi.org/10.1039/B001485K
• I. Gauthron, J. Gagnon, T. Zhang, D. Rivard, D. Lucas, Y. Mugnier, P. D. Harvey, Spectroscopic Identification and Electrochemical Behavior of the Dihydride Tetrapalladium Cluster (Pd₄(dppm)₄(H)₂)X₂ (X = Cl, Br),  Inorganic Chemistry, 1998, 37, 1112. https://doi.org/10.1021/ic970569+
• P. D. Harvey, R. Provencher, J. Gagnon, T. Zhang, D. Fortin, K. Hierso, M. Drouin, S. M. Socol, Photoinduced Oxidative Degradation of Unsaturated M₃(dppm)₃CO²⁺ Clusters (M = Pd, Pt) by Chlorocarbons and Chloride ion, Canadian Journal of Chemistry, 1996, 74, 2268. https://doi.org/10.1139/v96-255
• P. D. Harvey, J. Gagnon, R. Provencher, B. Xu, T. M. Swager, Tungsten and Molybdenum Oxo Complexes of Tetrakis(phenyldiazenyl)-calix[4]arene Substituted Derivatives: EHMO Calculations, Spectroscopic Characterization, and Perturbations of the Photophysical Properties by Neutral Guest Molecules, Canadian Journal of Chemistry, 1996, 74, 2279-2288. https://doi.org/10.1139/v96-256
• J. Gagnon, C. Loeber, D. Matt, P. D. Harvey, Preparation, Luminescence and Interactions with Li⁺, Na⁺ and UO₂²⁺ of Two New Metallocalix[4]arene Complexes of Iridium(I), Inorganica Chimica Acta, 1996, 242, 137. <https://doi.org/10.1016/0020-1693(95)04858-8
• R. Provencher, K. T. Aye, M. Drouin, J. Gagnon, N. Boudreault, P. D. Harvey, Ground-state Guest‑host Chemistry in the Hydrophobic Cavity of the Unsaturated Cyclic Pd₃(dppm)₃CO²⁺ Cluster, Inorganic Chemistry, 1994, 33, 3689. https://doi.org/10.1021/ic00095a012

• V. Langlois, M. Sirois, M.-G. Fortin, P.-O. Morisset, J. Gagnon, Optimization of a colorimetric method for the quantification of indole-3-acetic and indole-3-butyric acids in macroalgae, BENEFIQ Québec, 2018.
• J. Gagnon, Chitosan: From chemical transformations to applications, 17^th International Conference on Polymers and Organic Chemistry, Montpellier, France, 2018.
• J. Gagnon, Natural polysaccharides: From chemical transformations to applications, Universidad Pontifica Javeriana, Bogota, Colombie, 2018.
• J. Gagnon, Highly quaternized N,N,N-trimethylchitosan: A green methodology and applications, Conférences annuelles du CQMF, Sherbrooke, 2017.
• J. Gagnon, Highly quaternized N,N,N-trimethylchitosan: A green methodology and applications, 19^th Ontario-Québec Biotechnology Meeting, Lévis (Québec), 2017.
• J. Gagnon, Chitosan Derivatives: Cosmeceutical, Nutraceutical and Pharmaceutical Applications, 19^th Ontario-Québec Biotechnology Meeting, Lévis (Québec), 2017.
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes and B. Chabot, Development and treatment procedure of water contaminated by arsenate using a new and green chitosan sorbent: Kinetic, isotherm and dynamic studies, 19^th Ontario-Québec Biotechnology Meeting, Lévis (Québec), 2017.
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes and B. Chabot, Development and treatment procedure of water contaminated by molybdate using a new and green chitosan sorbent: Kinetic, isotherm and dynamic studies, 19^th Ontario-Québec Biotechnology Meeting, Lévis (Québec), 2017.
• J. Gagnon, Sequestration of metallic ions and silver nanoparticles in aqueous media using immobilized chitosan derivatives, 66^th Congres of Canadian Society for Chemical Engineering, Québec (Québec), 2016.
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes and B. Chabot, Development and treatment procedure of water contaminated by arsenate using a new and green chitosan sorbent: Kinetic, isotherm and dynamic studies, 66^th Congres of Canadian Society for Chemical Engineering, Québec (Québec), 2016.
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes and B. Chabot,Development and treatment procedure of water contaminated by molybdate using a new and green chitosan sorbent: Kinetic, isotherm and dynamic studies, 66^th Congress of Canadian Society for Chemical Engineering, Québec (Québec), 2016.
• J. Gagnon, Sequestration of metallic ions and silver nanoparticles in aqueous media using immobilized chitosan derivatives, conférence, 6^th International conference of IUPAC on green chemistry, Venise, Italie, 2016.
• R. Brion-Roby, J. Gagnon, J.-S. Deschênes and B. Chabot, Development and treatment procedure of watercontaminated by arsenate using a new and green chitosan sorbent: Kinetic, isotherm and dynamic studies, 6^th International conference of IUPAC on green chemistry, Venise, Italie, 2016.
• M.-L. Roy, J. Gagnon, C. Gagnon, Séquestration, quantification et devenir des nanoparticules d’argent dans les eaux usées, Congrès de l’ACFAS, 2015.
• A. Kibeche, J. Gagnon, C. Gagnon, Nouvelle méthode de séquestration des nanoparticules d’argent dans l’eau nanopure et l’eau de mer synthétique, Congrès de l’ACFAS, 2015.
• H. Gaaloul, G. Ferreyra, J.-P. Gagné, J. Gagnon, Transparent exopolymeric particles in the St.Lawrence estuary : distributions and effects of increasing ocean acidification and global warming, congrès de Québec Océan, 2015.
• J. Gagnon, Les résidus : un potentiel d’innovation, conférencier d’ouverture, La nature dans tous ses états, UQAR, 2015.
• M.-L. Roy, C. Gagnon, J. Gagnon, Séquestration et quantification des nanoparticules d’argent dans les eaux usées, présentation au CRABE, UQAR, 2014.
• A. Kibeche, J. Gagnon, C. Gagnon, Nouvelle méthode de séquestration sélective des nanoparticules d’argent dans l’eau à différentes salinités, 18^ème Colloque annuel du Chapitre Saint-Laurent à Québec, 2014.
• M.-L. Roy, C. Gagnon, J. Gagnon, Séquestration, quantification et devenir des nanoparticules d’argent dans les eaux usées, 18^ème Colloque annuel du Chapitre Saint-Laurent à Québec, 2014.
• J. Gagnon, Chitosan Derivatives: Cosmeceutical, Nutraceutical and Pharmaceutical Applications, Sustainable chemistry summit, Montréal, 2013.
• J.-M. Girard, J.-S. Deschênes, R. Tremblay, J. Gagnon, FT-IR/ATR Univariate and Multivariate Calibration Models for in situ Monitoring of Sugars in Complex Microalgal Culture Media, Algal BBB, Toronto, 2013.
• J. Gagnon, Highly quaternized N,N,N-trimethylchitosan: A green methodology and applications, 96^th Canadian Chemistry Conference and Exhibition à Québec, 2013.
• J.-M. Girard, J.-S. Deschênes, R. Tremblay, J. Gagnon, FT-IR/ATR Univariate and Multivariate Calibration Models for in situ Monitoring of Sugars in Complex Microalgal Culture Media, Biotech meeting of CSChe, Québec, 2013.
• PGC Campbell, JRC Fortin, J.-P. Gagné, J. Gagnon, E. Pelletier et C. Rouleau, Using a mesocosm approach to track silver nanoparticles in the mixing process of fresh and seawater, 96^th Canadian Chemistry Conference and Exhibition à Québec, 2013.
• M. Ben Hafsa, L. Beaulieu, L. Adambounou, A. Reyes, J. Gagnon, Composition chimique d’extraits de microalgues commerciales et détection d’activités antibactériennes, ACFAS, Montréal, 2012.
• J.-M. Girard, R. Tremblay, J.-S. Deschênes, J. Gagnon, Suivi de la consommation des sucres dans une culture de microalgues en présence de perméat de lactosérum par spectroscopie IR, CRIBIQ Conference, Sherbrooke, 2012.
• M. Ben Hafsa, L. Beaulieu, L. Adambounou, A. Reyes, J. Gagnon, Extraction et caractérisation de polysaccharides extraits de microalgues commerciales, Conférence à l’Université de Tunis, 2011.
• J. Gagnon, Asymmetric Transfer Hydrogenation from a Polysaccharide Ruthenium Catalyst, International congress of IUPAC, Ottawa, 2010.
• M. Babin, F-G. Fontaine, J. Gagnon, Natural biopolymer chirality at work!, 92^th Canadian Chemistry Conference and Exhibition, Toronto, 2010.
• M. Babin, J. Gagnon, F.-G. Fontaine, Coordination chemistry of soluble chitosan polyligands in the design of polymeric asymmetric catalysts, 92^th Canadian Chemistry Conference and Exhibition at Hamilton, 2009.